袭封父爵
卫錞的曾祖父卫青，在明英宗时官至左军都督府都督佥事；祖父卫颖，历经五朝，曾掌后军都督府事，封爵宣城伯。卫錞的父亲卫璋，袭爵成为第二代宣城伯。
卫錞生于明宪宗成化九年（1473年），于明武宗正德十三年（1518年）正月袭封父亲的爵位，成为第三代宣城伯。他最初担任右军都督府佥书一职。
屡掌京营
正德十五年（1520年）八月，宣府戒严，卫錞与南宁伯毛良、都督陈义各自奉命于十二团营中“坐营领操”。次年二月，卫錞掌果勇营，与襄城伯李全礼同为坐营管操。
嘉靖元年（1522年）至嘉靖三年（1524年）间，卫錞先任前军都督府佥书，后调补为奋武营坐营管操、提督神机营事。
嘉靖七年（1528年）三月，卫錞掌右军都督府事，仍管理神机营事务。
世宗宠眷
嘉靖八年（1529年）九月，卫錞与工部右侍郎苏民负责修建仁寿宫。次年五月，世宗因朝廷在京师周围大兴工役，于是命卫錞与武定侯郭勋、大学士张璁知建造事，“督视规制，总督工程”。其中，卫錞负责兼领官军。至第二年七月，京师四郊完工，卫錞被加官太子太保。
嘉靖十二年（1533年），大同府再次发生兵变。十一月，世宗责令兵部于勋臣中推举人选前往讨伐，兵部尚书王宪举荐卫錞等三人。不久后，世宗认为“大同小变，不足以烦朝廷”，于是仍令宣大总督刘源清自行平乱。
嘉靖十五年（1536年）三月、四月间，世宗出巡，卫錞先后与户部尚书梁材、刑部尚书唐龙居守京师。
嘉靖十八年（1539年）正月，卫錞被加授为太保。至此，他身兼太保兼太子太傅（《明史》作太子太师）二官。二月，世宗出巡承天府（今湖北钟祥），命卫錞与遂安伯陈鏸为留守使，协助皇太子朱载壡监国。同月春分节，“祭大明于朝日坛”，卫錞代皇太子行祭礼。
晚年及致仕
嘉靖二十一年（1542年）五月，卫錞奉命掌后军都督府事。
嘉靖二十九年（1550年）十二月，卫錞遭言官弹劾在官不称职。兵部覆议，建议让卫錞致仕，世宗允准。卫錞于是不再仕官。
耄耋而终
嘉靖三十六年正月丁卯日（1557年2月11日），卫錞逝世，享年八十五岁。世宗按例赐祭葬，追赠他为太傅，赐谥号“康靖”（按明《谥法》称“温良（柔）好乐曰康，宽乐令终曰靖”）。
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