朱拱树早年为瑞昌王母鲍氏抚养。九岁时,适逢宁王朱宸濠作乱,其父朱宸渥不从,被幽禁,鲍氏及其母戴氏日夜哭泣,担心朱宸濠得天下后杀了朱宸渥,朱拱树却料定朱宸濠不会得天下,必败无疑。王守仁攻陷南昌时,鲍氏和戴氏都准备上吊,被朱拱树制止,朱拱树又效法外黄小儿主动前去游说王守仁部将王伟,从而获得保护。十五岁时,封辅国将军。他平时生活基本就是读书吟咏以及与文人交往,读书至三万余卷,并向明世宗请书,世宗下赐御制敬一箴、五经、四书及《性理大全》。他还认为明朝宗室制度不合理,给地方带来不小的负担,应借鉴汉朝的降袭法来加以变通。六十岁以后读《金刚经》。万历十一年(1583年)五月十四日去世,享年七十三岁。