被废宗籍
元昌是咸阳王元禧庶子，在父亲元禧谋反被诛后，被断绝宗室属籍。
得到救济
元昌和兄弟们穷困，时常缺少衣服和食物，叔叔彭城王元勰收养了他们，也只有元勰一年之中再三接济供给他们。
投奔南梁
遇到大赦，哥哥元翼向朝廷上书请求埋葬自己的父亲，元翼接连哭着请求了几年，魏宣武帝元恪没有准许。元昌于是和兄弟元翼、元晔在天监五年三月癸未（506年4月26日）投奔南梁。被梁武帝授予直阁将军。
祖父
拓跋弘，献文帝
父亲
元禧，咸阳王
嫡母
陇西李氏，北魏镇远将军、颍川太守、襄武惠侯李辅之女
生母
申屠氏，生元翼、元昌，景明元年岁次庚辰二月辛未朔廿八日戊戌（500年4月12日）下葬
兄弟姐妹
元通
元翼，南梁信武将军、青冀二州刺史、咸阳王
元显和
元树，南梁镇西将军、郢州刺史、邺王
元晔，南梁散骑常侍、桑乾王
元坦，北齐特进、开府仪同三司、新丰县公
元昶，东魏车骑大将军、仪同三司、太原王
元仲英，乐安公主，嫁闾伯昇
上庸公主，嫁陆子彰
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