《唐故银青光禄大夫国子祭酒上柱国魏郡开国公驸马都尉裴公墓志铭并序》记载:
长寿二年(693年),裴巽凭借门荫,候补梁王(武三思)府执任,转任均州司仓参军,接近庐陵王李显。圣历元年(698年),李显回到神都洛阳,重立为皇太子后,将女儿义安郡主下嫁裴巽。裴巽特加朝散大夫、太子典设郎、左监门卫中郎将。
神龙革命后,唐中宗复位,将义安郡主进封宜城公主。裴巽成为驸马都尉,转任鸿胪少卿、银青光禄大夫,迁鸿胪卿。裴巽纳了一个美貌的小妾。宜城公主大怒,割断了裴巽的头发,还派人割去小妾的耳鼻,让她失去面目见人,又把其阴部的皮剥下来,蒙到驸马的脸上。在御史弹劾下,公主降级郡主,裴巽外任鄜州刺史。回京历任卫尉卿、鸿胪卿,外任许州刺史,再拜光禄卿、上柱国,封魏郡开国公。
谯王李重福叛乱时,曾经住在洛阳裴巽宅第。宜城公主死后,再娶唐睿宗之女薛国公主。裴巽丁忧后,任国子祭酒,住在长安城延寿坊东南隅。
开元十四年(726年)八月十九日,裴巽病卒于家中,时年五十五岁。