朱骥早年承袭官职，任锦衣卫千户。后在吴宁推荐下，成为于谦女婿。天顺元年（1457年），明英宗复位，岳父于谦被杀，朱骥将其安葬，后来因他是于谦亲族，被谪戍威远。
明宪宗即位，将朱骥赦免，官复原职。成化二年（1466年）九月，升任锦衣卫指挥佥事，协理卫事。后来又因擒捕妖言之功和在谪所立下的战功，升任指挥同知。
成化十二年（1478年）九月，朱骥升为指挥使，掌管锦衣卫。
成化十九年（1485年）二月，明宪宗加封朱骥为都指挥佥事，命其仍掌锦衣卫。
成化二十年十二月（1487年1月），朱骥被加封为都指挥同知，命其仍掌锦衣卫。
成化二十二年（1488年）三月，朱骥被加封为都指挥使，依然掌锦衣卫。
弘治三年十二月十六日（1491年1月25日），朱骥去世。
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