元孝矩,河南洛阳人也。祖元修义,父元子均,并为西魏尚书仆射。
元孝矩在西魏时,袭爵始平县公,拜南丰州刺史。时见周太祖(宇文泰)专政,将危元氏,元孝矩每慨然有兴复社稷之志,阴谓昆季曰:“昔汉氏有诸吕之变,朱虚(刘章)、东牟(刘兴居),卒安刘氏。今宇文泰之心,路人所见,颠而不扶,焉用宗子?盍将图之?”为兄则所遏,元孝矩乃止。其后周太祖为兄子晋公宇文护娶孝矩妹为妻,情好甚密。
北周孝闵帝受禅,宇文护总百揆,元孝矩之宠益隆。及宇文护诛,坐罪徙蜀。数战,征还京师,拜益州总管司马,转司宪大夫。
隋高祖杨坚重其门第,娶其女为房陵王杨勇之妃。及高祖为丞相,拜少冢宰,进位柱国,赐爵洵阳郡公。时房陵王镇守洛阳,及上()受禅,立为皇太子,令元孝矩代镇。既而,立其女为皇太子妃,亲礼弥厚。俄拜寿州总管,赐元孝矩玺书曰:“扬、越氛昆,侵轶边鄙,争桑兴役,不识大猷。以公志存远略,今故镇边服,怀柔以礼,称朕意焉。”时陈将任蛮奴等屡寇江北,复以元孝矩领行军总管,屯兵于江上。后数载,自以年老,筋力渐衰,不堪军旅,上表乞骸骨。转泾州刺史,高祖下书曰:“知执谦捴,请归初服。恭膺宝命,实赖元功,方欲委裘,寄以分陕,何容便请高蹈,独为君子者乎!若以边境务烦,即宜徙节泾郡,养德卧治也。”在州岁余,卒官,年五十九,谥号为简。子元无竭嗣位。