直谏明武宗
十九岁时，被李梦阳所器重。
正德八年（1513）举人，正德九年（1514）进士，观政礼部。陈九川忽觉仕途艰难，三次上疏请求休假，得到批准。
正德十年（1515），师从王守仁于虔州。
正德十二年（1517），授太常博士。
正德十四年（1519），明武宗南巡，吏部员外郎夏良胜上疏，与礼部主事万潮、陈九川、舒芬署名进谏反对，触怒明武宗，跪午门外五日，杖五十，削籍为民。
师从王守仁
正德十五年，（1520），跟随王守仁毕业。
明世宗即位，官复原职。
嘉靖二年（1523），升任礼部仪制司员外郎，奉命册封弋阳王。
嘉靖三年（1524），侍奉王守仁于浙江。
诬陷被贬
嘉靖四年（1525），升任礼部主客司郎中。正贡献名物，节省贡使犒赏费数万。正好，天方国进贡玉石，陈九川剔除其中不堪的人。贡使要求得到蟒衣，没有奏覆，又怒骂通事胡士绅等。胡士绅怨恨陈九川，假借番人词诬陷陈九川及会同馆主事陈邦偁。明世宗大怒，将二人打入诏狱。当时，张璁、桂萼想要扳倒费宏，夺其职位，于是指使胡士绅再次诬陷陈九川盗取贡玉，馈赠费宏制作玉带，供词牵连兵部郎中张𦒎、锦衣卫指挥张潮等。明世宗愈加愤怒，将张𦒎等人一并打入诏狱。指挥骆安请求让胡士绅质讯，给事中解一贯等也同意他的建议，明世宗不许。
嘉靖五年（1526），狱成，陈九川贬戍镇海卫，陈邦偁等削籍。
嘉靖八年（1529），遇赦放还。在台宕山、罗浮山、九华山、庐山等地讲学。晚年失听，书札论学不休。
嘉靖四十一年（1562）八月，去世。
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