邓叔群1902年12月12日，邓叔群出生于福建闽侯（今福州市）。
1914年，在闽侯小学毕业。
1915年，考入清华学堂留美预备班学习。
1923年，从清华学校毕业，进入美国康奈尔大学农学院林学系。
1925年，从康奈尔大学林学系毕业，进入康奈尔大学研究院学习深造。
1926年，获得康奈尔大学森林学硕士学位，并转入康奈尔大学植物病理学系。
1928年，获得康奈尔大学植物病理学博士学位；同年，任岭南大学植物病理学教授。
1929年1月，任金陵大学造林学教授。
1929年8月，任南京中央大学农学院教授。
1955年，邓叔群在访问匈牙利期间1931年，在南京中央农业实验所筹备处任技正。
1932年，任中国科学社自然历史博物馆研究员。
1933年，任中央研究院动植物研究所研究员。
1941年，任甘肃水利林牧公司森林部经理；同年秋，任农林部中央林业实验所副所长。
1946年，到上海中央研究院职务研究所工作，创建森林生态学研究室。
1948年，当选为台湾“中央研究院”院士。
1949年9月，任沈阳农学院教育长；10月，任上海中央研究院植物研究所研究员。
1950年，任东北农学院副院长。
1955年4月，任中国科学院植物所真菌植病室副主任；5月，当选为中国科学院学部委员（院士）。
1956年，任中国科学院应用真菌研究所副所长。
1958年，任中国科学院微生物研究所副所长。
1970年5月10日，在北京逝世，享年69岁。
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