1394年,恩克汗死后,瓦剌与东蒙古正统派达成妥协,拥立脱古思帖木儿次子额勒伯克为大汗,号“尼古哷苏克齐汗”,大汗之位从阿里不哥后裔手中被夺回,忽必烈家族复辟。在额勒伯克被拥立为蒙古大汗的过程中,瓦剌绰罗斯部掌管军队的浩海达裕起到了主要的作用。
额勒伯克虽然是正统的元裔,却并没有很好地履行大汗的职责,为君德行很差,在位五年期间毫无作为。反而残忍好色。因为听到身边的浩海达裕说自己的弟媳美貌,竟然荒唐的杀死了胞弟哈尔古楚克都古楞特穆尔洪台吉,并霸占了弟媳鄂勒哲依图鸿郭斡妣吉。由于浩海达裕谏言有功,把浩海达裕封为丞相。这已经是违背人伦的倒行逆施了,可鄂勒哲依图鸿郭斡妣吉被大伯霸占后,一直想为夫君报仇,便在可汗耳边说浩海达裕的坏话,这位可汗不分辨是非曲直,便下令处死了浩海达裕。待得知浩海达裕冤枉后,为了弥补过失,将女儿萨穆尔公主嫁给浩海达裕的儿子巴图拉(马哈木),并封巴图拉为丞相,许诺他今后统领瓦剌四部。后来巴图拉成为了瓦剌部的一代枭雄。
此时统领瓦剌部的仍然是“瓦剌王”乌格齐哈什哈。他得知瓦剌的统帅权将要被巴图垃取而代之,额勒伯克为霸占弟媳而杀害了自己的胞弟,这两件事无疑严重激怒了他,乌格齐哈什哈大怒道“汗政治不端,杀弟哈尔古楚克洪台吉,以弟妇洪拜济(鄂勒哲依图鸿郭斡妣吉)为福晋,淫虐乱法,复被洪拜济所欺,杀臣浩海,以有次耻。乃既我在,而令我属人巴图拉管辖四卫拉特耶?!”于是在1399年,乌格齐哈什哈带领他的瓦剌兵攻打汗廷。额勒伯克是由蒙古众部落首领拥立的,没有多少实力,如何能抵挡,很快便被乌格齐哈什哈袭杀。这是北元第二次臣弑君事件。这场变故,使得好不容易复辟的忽必烈家族又失去了汗位,不但东蒙古正统派损失惨重,乌格齐哈什哈还“降蒙古人众大半”,蒙古高原很多部落不得不屈服于瓦剌的统治之下。额勒伯克的儿子本雅失里在父亲被杀后逃往中亚帖木儿帝国避难。
额勒伯克所统治下的北元可谓是北元时期最黑暗的年代,蒙古部众明朝军队连年征讨下,过着贫苦潦倒、民不聊生的苦难生活,畜牧业经济收到严重破坏。另外,蒙古大汗权力旁落,异姓贵族大权独揽操纵汗廷,大汗每每被弑杀。