柴禹锡少年时，有客人见到他说：“你资质不凡，如果学习经术，必将位至将相。”柴禹锡从此留心治学。当时宋太宗赵光义仍是晋王，柴禹锡因为善于应对，得以在晋邸供职。

太平兴国初年，太宗授柴禹锡为供奉官。

太平兴国三年，改为翰林副使，升任如京使，并掌翰林司事。

柴禹锡每次夜晚值班，太宗因他是晋邸旧僚，经常召见询问宫外的事务。后升为宣徽北院使，在宝积坊赏赐住宅。又因诬陷秦王赵廷美一事，得以擢升为枢密副使。过了一年，再转任宣徽南院使。柴禹锡任官已久，更加勤勉。

雍熙年间，商议扩建宫城。柴禹锡有别墅在规划地域内，请求交换官邸，宋太宗因此轻视他。他又与宰相宋琪交好。适逢广州徐休复密奏转运使王延范不合法度的情形，而且说他攀附大臣，无人敢动摇。宋太宗因此询问宋琪、柴禹锡：“王延范是什么样的人？”宋琪的妻子与王延范是远亲，所以他极力陈说王延范忠诚勤勉，柴禹锡也在一旁帮着说话。宋太宗认为他们结党包庇，更加不悦。柴禹锡又为宋琪请求故相卢多逊的旧宅，宋太宗愈加恼怒，于是以“诙谐”为名罢免宋琪，并下诏切责柴禹锡，命他以左骁卫大将军出知沧州。

柴禹锡在沧州任上勤于治理，所辖百姓到滨州列举情况上报。改任涪州观察使，移任澶、镇二州驻泊部署。不久改知潞州，州内百姓请求延留柴禹锡三年，宋太宗下诏褒奖他。后来，移知永兴军，被召回朝廷，升任宣徽北院使、知枢密院事。

至道初年，授镇宁军节度使、知泾州。入朝拜谢之日，太宗对他说：“从宣徽院免职的人不过授防御使罢了，现在赐你旌节，加兼重镇，可谓优待了。”柴禹锡闻言，流泪哽咽。

咸平年间，调知贝州。当年，辽国军队突然来到城下，柴禹锡在城内严密守备，辽军不久退去。第二年，移知陕州。

景德初年，柴禹锡的孙子柴宗庆娶宋太宗第四女鲁国长公主，成为驸马，“升其行为禹锡子”。宋真宗于是召柴禹锡回朝，让公主到他的住宅拜见，行舅姑之礼。柴禹锡坚持推辞，不被允许。

之后，柴禹锡返回军镇，不久后便去世，享年六十二岁，被赠官太尉。