曹魏景元三年（263年），荀崧出生于名门之家，为荀彧玄孙，荀頵之子。很小时候，堂曾祖父荀顗（荀彧之子）看中他可以光耀门楣。成年后，喜好文学，志趣高雅，与王敦、顾荣、陆机等人结交。后来赵王司马伦任命他相国参军，累官至侍中、中护军。
王弥攻破洛阳，荀崧与百官逃奔到密县。还没有到的时候母亲去世了，他驾车载着母尸与同行的官员失散，被王弥的士兵追上砍成重伤。后来苏醒过来，于是把母亲下葬在密山。丧期结束后，担任襄城太守，进爵舞阳县公。后来，都督荆州江北诸军事、担任平南将军，镇守宛，改封曲陵县公。宛城被杜曾包围，女儿荀灌突围出城请来救兵，成为历史上的一段佳话。
随东晋朝廷渡江后，征拜尚书左仆射，与刁协共定中兴礼仪制度。
苏峻之乱时期，晋成帝被挟持到石头城，荀崧侍奉在成帝身边不曾离开。动乱平息后，晋成帝前往温峤所在的船上，荀崧年老又生重病，却仍然跟随。太宁初年，加散骑常侍，后领太子太傅。以平王敦之功，更封平乐伯。坐使威仪为猛兽所食，免职，累官至右光禄大夫、录尚书事。年老后，依旧不倦学习。
咸和三年（328年），荀崧去世，时年六十七岁。加赠侍中，谥号为“敬”。
升平四年（360年），荀崧改葬，晋穆帝下诏赐钱一百万、布五千匹。
《晋书·卷七十五·列传第四十五》
王济：近见荀监子，清虚名理，当不及父，德性纯粹，是贤兄辈人也。
虞预：伏见前秘书监、光禄大夫荀崧，生于积德之族，少有儒雅之称，历位内外，在贵能降。苏峻肆虐，乘舆失幸，公处嫌忌之地，有累卵之危，朝士为之寒心，论者谓之不免。而公将之以智，险而不慑，扶侍至尊，缱绻不离。虽无扶迎之勋，宜蒙守节之报。且其宣慈之美，早彰远近，朝野之望，许以台司，虽未正位，已加仪同。至守终纯固，名定阖棺，而薨卒之日，直加侍中。生有三槐之望，没无鼎足之名，宠不增于前秩，荣不副于本望，此一时愚智所慷慨也。今承大弊之后，淳风颓散，苟有一介之善，宜在旌表之例，而况国之元老，志节若斯者乎。
沈约：自汉末剥乱，旧章乖弛，魏初则王粲、卫觊典定众仪；蜀朝则孟光、许慈创理制度；晋始则荀顗、郑冲详定晋礼；江左则荀崧、刁协缉理乖紊。
房玄龄：①景猷履孝居忠，无惭往烈。范玄平陈谋献策，有会时机。崧则思业该通，缉遗经于已紊。汪则风飚直亮，抗高节于将颠，扬榷而言，俱为雅士。荀范令望，金声远畅。
荀崧著有文集一卷，今已佚。《全晋文》辑录有其文六篇：《上疏请增置博士》、《议王式事》、《议上元帝庙号》、《答卞壶论刘嘏同姓为昏》、《与王导书》、《与王敦书》。
曾祖
荀恽：曹魏太尉荀彧之子，字长倩，嗣侯，官至虎贲中郎将。因与曹植有交情，被曹丕憎恨，早卒。妻子为曹操之女安阳公主。
祖父
荀甝：荀恽长子，散骑常侍，进爵广阳乡侯，死时三十岁。
父亲
荀頵，荀甝之子，为羽林右监，早卒。
同辈
荀馗，荀崧从弟，早亡。
子女
荀蕤，荀崧之子，字令远，建威将军、吴国内史。
荀灌，荀崧之女，历史上有名的少年女英雄。
荀羡，荀崧次子，字令则，二十八岁就官至东晋北中郎将、徐兖二州刺史，假节。时人称之为荀中郎。同娶公主，成为驸马都尉。
荀序，荀馗之子，后由荀崧抚养，临淮公荀顗国胤绝，序嗣袭封。
荀廞，荀馗之子，后由荀崧抚养。
孙子
荀籍，荀蕤之子，嗣位，至散骑常侍、大长秋。
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