嘉定三年(1210)春天,魏了翁在邛州(今四川邛崃)城西的白鹤山下创建的书院落成。因为书院在白鹤山下,而魏了翁的号又叫鹤山,这个书院就被命名为“鹤山书院”。魏了翁是南宋著名的理学家。开禧二年(1206)八月,魏了翁到嘉定做了知府。第二年,韩侂胄被杀,发动政变的史弥远逐渐掌握大权,多次召他去都城,都被他拒绝。魏了翁丁父忧辞去官职后,隐居在白鹤山下创办书院,授徒讲学。书院落成后,恰好碰上朝廷取士,他的弟子在考试中十之八九被选中,一时传为美谈。书院因此声名鹊起,各地学子纷纷慕名而来,络绎不绝。魏了翁将原来的书院进行扩建,并且搜访各地的传录图书,一共多达10万卷,他还在鹤山书院中建造了尊经阁用来藏书。鹤山书院成为南宋最著名的书院之一。