康熙九年（1670），祖良璧继其兄祖良栋，袭一等子世职。

康熙十九年（1680），授参领，兼佐领。

康熙二十九年（1690），从裕亲王福全征噶尔丹，侦查到敌军埋伏在乌兰布通，阻阿据林阜，结驼阵防守。祖良璧随左翼兵，由山腰奋击，大败贼众，覆其巢。

康熙三十年（1691），擢西安副都统。

康熙三十五年（1696）二月，抚远大将军费扬古由西路剿噶尔丹，祖良璧请从军。上以西路军粮屯翁吉，命偕副都统席尔哈达留兵督运。六月，由巴罕厄里根赴纳喇特，遇风雨，牲畜道毙，不能前，以状闻。时噶尔丹已为费扬古所败，携其从子丹济拉由昭莫多西遁，上虑其劫翁吉粮，诏祖良璧速归翁吉，以所运米支给运丁，余悉焚之，祖良璧得旨驰还。九月，将护粮赴宁夏，丹济拉果率贼数千伏翁吉山谷中，侦我军半度突出，祖良璧麾殿后兵力战，前军还击，贼大败逐北二十余里。上方闻丹济拉骤至，虑祖良璧势孤及奏捷，优诏嘉奖。

康熙四十二年（1703）十一月，上西巡，阅西安兵。谕大学士马齐曰：满洲兵丁整肃，俱系将军、副都统训练所致，着各加一级。十二月，调正蓝旗汉军副都统。

康熙四十四年（1705），上追念祖良璧翁吉破贼功，且人材亦优，擢福州将军，赐孔雀翎及蟒服、鞍马。

康熙四十六年（1707），上南巡，祖良璧至清江浦迎驾，御书“兵民协辑”额及“四时常喜戈船静，千里须教璧垒新”联赐之，并衣一袭。

康熙四十九年（1710），闽浙总督梁鼐丁忧，特旨以祖良璧署理。

康熙五十二年（1713），至京恭庆万寿，赐冠服。寻遣还任。

康熙五十七年（1718），卒，改世职为一等男兼一云骑尉，子祖应枢袭。