《射雕英雄传》
昔年南帝段智兴出家为僧后,法名一灯,带同渔樵耕读四大弟子一同隐居。
这期间武三通在大雪山采药与欧阳克相遇,两人斗成平手,欧阳锋转而将武三通打伤,迫使一灯大师带领四个弟子离开大理国。
后为了等待二次华山论剑,四弟子禁止外人向师父求医而耗费内力。然而当黄蓉受伤时,郭靖带同黄蓉照著瑛姑的指示向一灯求医,四弟子竭力阻挠,不料一一被突破,其中武三通与郭靖比武时亦败于郭靖。后一灯治愈黄蓉,并且借由九阴真经恢复内力,最后亦参加二次华山论剑。后来大理国灭亡,武三通与师兄弟们护着段智兴离开。
《神雕侠侣》
开头时即透露武三通虽已成婚,但对养女何沅君却有着特殊的感情
后何沅君与陆展元成婚时,武三通曾与李莫愁大闹婚礼,不料却被高人阻回。后武三通的妻子武三娘为丈夫吸取针毒而死,武三通感念其恩,遵照其遗愿保护两个儿子长大。然而武三娘身陨时,武三通疯性大发,竟弃二子而去。
武三通疯疯癫癫的在江湖上混了数年,时日渐久,疯病倒也慢慢全愈了。点苍渔隐参与大胜关英雄大会之后回山,与几个武林结伴同行,交谈中听他们说起有这样一个人物,模样似与师弟武三通相像,转辗寻访,终于和他相遇。
武三通听得两个爱子已然长成,大喜之下,便来襄阳探视,正遇他们为郭芙而手足相残,悲伤不已,适得杨过路过,武三通败于杨过的机灵下,而杨过使巧计让武氏兄弟不再争斗,并为武氏兄弟吸去李莫愁的冰针之毒。武三通视杨过为恩人,双方所言甚欢,成为忘年之交。
武三通听闻杨过所中情花之毒,携二子与师叔师弟奔赴绝情谷为杨过寻解药,中途受伤,为黄蓉所救,武三通与黄蓉一行人又遇李莫愁,交战后被困,幸得杨过搭救。
绝情谷事毕,武三通与其他武林人士奔赴襄阳,助郭靖抗元。
《倚天屠龙记》
武三通的后人武烈,武青婴父女与朱子柳后人密谋夺取张无忌义父谢逊的屠龙刀,被张无忌识破,后被金花婆婆抓到灵蛇岛,最后为武当派宋青书所救。