成化十六年(1480),袭祖父爵。孙铭自幼庄重沉毅,没有纨绔习气,嗜读小学武书,习射艺,天性甚孝。累次奉命册封亲藩,不收馈遗。
成化十九年(1483),得到兵部推举,管理三千营。
弘治十四年(1501),迁五军营,转耀武营。
弘治十七年(1504),兼理殚忠营、孝义营。
正德元年(1506),改坐奋武营,后掌府军前卫事。
正德四年(1509),提督神机营军务,佥后军都督府事。西夏平,以功,加太保,赐金牌、彩币。明武宗曾御大内演武,孙铭以技能称上意,赐蟒衣、宝钞,命掌右军都督府事。转中军都督府。
正德末年,明武宗北巡南征,孙铭总管营务,于是与文武重臣同心协议,昼夜忧勤,保固京师,中外倚重,以劳成疾不起,卒。孙铭弥留之际,嘱咐其子孙臬说:“予德薄,官以世爵,兼太保名位已极,恨无以报国恩。身后勿请谥赠,以重予咎。”孙臬遵照其言。