14岁时，就当了供奉官。赵匡胤曾经召集开国功臣的子弟询问时事，在这些功臣子弟中，石保兴年龄最小，但回答赵匡胤提出的问题时，条理清楚，赵匡胤很惊奇。开宝年间（968～975），石保兴领顺州刺使。太平兴国四年，宋太宗亲征北汉时，任御寨四面都巡检。太平兴国八年（983）任高阳关监军。雍熙初年，契丹军入侵，石保兴奉命驻守澶州前线。不久，西夏军又入侵宋朝边境，石保兴率两千士兵在黑水河大败西夏军。之后又任西京都巡检使。淳化五年（994），任团练使。至道二年（996），任延州（今陕西延安）都巡检使兼署州事，率军平叛，三天打了四十二仗，后升任本路副都部署。咸平二年（999），知威虏军，在与夏国战争中“发官帑钱数万缗分给战士”打退了夏军而立功，后任知州。咸平三年（1000），任棣州防御使。咸平五年（1002），因病回汴梁（今开封），不久病故。
建隆初年，以父荫补供奉官，迁尚食副使、如京使，领顺州刺史。跟随宋太宗攻打北汉，抵抗契丹入侵。多次打败西夏军队，镇守西陲地区。参加檀渊之战，累迁澶州防御使，封西平郡公。
咸平五年八月，去世，时年五十八岁。
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