吕氏是太常卿吕本之女，最初为太子朱标的次妃。

洪武十年（1377年）十一月初五，生太子次子朱允炆。

洪武十一年（1378年）十一月，太子妃常氏去世。之后吕氏被册封为太子妃。

因为史料遗失和故意删减，《明史》和《明实录》没有吕氏被册封为太子妃的具体时间。

只有《胜朝彤史拾遗记》称“洪武十一年，册为皇太子继妃。”

洪武十四年（1381年）十二月，太常司卿吕本卒。《明实录》称“本无子，其女为皇太子妃。”

洪武十六年（1383年）八月初十，马皇后的小祥祭礼，参加祭礼的后宫妃嫔中有“皇太子妃”即指吕氏。

洪武十八年（1385年）六月二十日，生太子第四子朱允熞。

洪武二十四年（1391年）六月十二日，生太子第五子朱允熙。

洪武二十五年（1392年）四月二十五日，皇太子朱标薨，谥号懿文。由于太子元妃常氏所生的朱标长子朱雄英八岁夭折，九月十二日或记为九月十三日，明太祖册封太子继妃吕氏所生的朱标次子朱允炆为皇太孙。

建文元年（1399年）二月，尊为皇太后。

靖难之役时，燕王朱棣的士兵攻入金川门将吕太后迎接到军营，朱棣向吕太后行再拜之礼，并诉说自己起兵的原因，吕太后“无一言慰劳而返”。及返，皇宫已经起火，吕太后跟随幼子朱允熙居住在懿文太子朱标陵园里。

永乐元年（1403年），吕氏被革除太后名号，复称皇嫂懿文太子妃。

永乐四年（1406年），朱允熙因为宅邸失火而死，吕妃遂不知所终。

弘光元年（1645年），明安宗朱由崧恢复吕太后名号。