哈剌章少年时受教于南人学者郑深，郑深“教以书诗，得师道甚，太师（脱脱）称誉弗置口，至有闻于上（元顺帝）者”。

当时，顺帝长子爱猷识理达腊养育于脱脱家，与哈剌章“同卧起”，1347年（至正七年），脱脱侍奉其父马札儿台出居甘州，哈剌章留在京师，托管于郑深，并与爱猷识理达腊玩耍。

有一天，顺帝与爱猷识理达腊之母奇皇后同坐于偏殿内，哈剌章与爱猷识理达腊嬉戏于殿外，爱猷识理达腊让哈剌章背着自己，自己发出老鸦的声音，绕殿阶上的空地转三圈，接着又叫哈剌章做老鸦，自己来背哈剌章。

哈剌章跪着说：“我哈剌章是奴婢，您是使长，奴婢不敢让使长背着。”爱猷识理达腊大怒，遂用鞭子抽他，哈剌章的哭声被顺帝听见。

顺帝问：“谁在哭？”左右说：“是脱脱的儿子哈剌章在哭。”又问：“为什么哭成这样？”左右将事情原委禀告顺帝。

顺帝大喜道：“这孩子真是贤明啊！”奇皇后趁机说道：“脱脱也是好人，不能让他长期在外面。”顺帝点头。不久后，奇皇后秘密召还脱脱，并在顺帝心情好的时候把哈剌章带到顺帝面前，对他说：“你也想念你爸爸脱脱吗？”

哈剌章说：“想！”顺帝听出了奇皇后的言外之意，说：“你想让他见脱脱，那脱脱现在在哪里？”奇皇后遂引脱脱入见，于是脱脱又拜为丞相。

1354年（至正十四年），脱脱在出征高邮途中被奸臣陷害，贬谪淮安路；1355年（至正十五年），又将脱脱流放到云南腾冲，后脱脱被奸臣哈麻矫诏杀于阿轻乞之地，哈剌章及其两个弟弟也被流放，哈剌章被安置于肃州。

直到1362年（至正二十二年），才恢复了脱脱官爵，并召还哈剌章及其弟三宝奴。哈剌章先被授予中书省平章政事，封申国公，分省大同；1365年（至正二十五年）迁为知枢密院事。

1368年（至正二十八年）闰七月，明军逼近大都，元顺帝欲弃城出逃，哈剌章力谏不可，“大意谓贼已陷通州，若车驾一出都城，立不可保，金宣宗南奔之事可为殷鉴，请死守以待援兵”。但顺帝不听。而后他随顺帝北奔上都。

哈剌章在随顺帝出逃期间，力图恢复大元江山，他先请求顺帝召扩廓帖木儿（王保保）入援，后又计划联合西北藩王反攻大都，但顺帝鉴于阿鲁辉帖木儿事件而恐惧西北诸王，故迟迟无法展开。

1369年（至正二十九年）六月，他又随顺帝北自上都奔应昌，途中授哈剌章开府仪同三司，封徐国公，同年八月又拜他为太保，哈剌章多次推辞，但不许。

后来哈剌章随元昭宗爱猷识理达腊从应昌逃走，并成为北元的重臣，曾屯兵沈阳，并参与1372年（宣光二年）的漠北会战。

1388年（天元十年），哈剌章被明将蓝玉击败，获其部下军士15803户，马驼48150余匹。后来他的子侄纷纷归降明朝，但他仍然在骚扰明朝边境。

1396年，有情报显示哈剌章逃往速剌讨来川（今讨赖河），明太祖命令追击。以后不知所终。

学者曹永年认为北元重臣哈剌章与脱脱之子哈剌章可能不是同一人。